Codeigniter es un framework PHP que nos facilita muchas cosas, coomo por ejemplo el Active Record.
Para  unir 3 'tres' tablas en codeigniter con Active Record es mucho mas fácil que hacer una consulta directamente en la consola de nuestro sistema gestor de bases de datos, Vean.

Supongamos que tenemos estas tres tablas

1. A = id_a, name_a,...  
2. B = id_b, name_b, etc  
3. C = id_c, A_Id_a, B_Id_b